{%set sample=sample_list|first%}
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  <title>layui</title>
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                <div class="layui-col-xs12">
                    {% block background %}
                    <h1>测序数据质控</h1>
                    <p>
                        Illumina测序属于第二代测序技术，单次运行能产生数百万级的Reads，如此海量的数据无法逐个展示每条Read的质量情况；运用统计学的方法，
                        对所有测序Reads的每个Cycle进行碱基分布和质量波动的统计，可以从宏观上直观地反映出样本的测序质量和文库构建质量。
                        我们针对每一个样本的原始测序数据进行测序相关质量评估，包括A/T/G/C碱基含量分布统计和碱基质量分布统计。
                    </p>
                    {% endblock %}
                </div>
                <div class="layui-col-xs12">
                    {% block parameter %}
                    <h3>参数设置</h3>
                    <p>质控软件：Fastp</p>
                    {% endblock %}
                </div>
                <div class="layui-col-xs12">
                    <div class="layui-tab layui-tab-brief">
                        {% block tab %}
                        <ul class="layui-tab-title">
                            <li>测序数据统计</li><li>碱基含量分布</li><li>碱基质量分布</li>
                        </ul>
                        <div class="layui-tab-content">
                            <div id="测序数据统计" class="layui-tab-item layui-show">
                                <table class="layui-table" lay-filter="demo">
                                    <thead>
                                        <tr>
                                        <th lay-data={align:"center",width:150,sort:true,field:"sample"}>sample</th>
                                        {%for col in dict_sub[sample]%}
                                        <th lay-data={align:"center",width:150,sort:true,field:"{{col[0]}}"}>{{col[0]}}</th>
                                        {%endfor%}
                                        </tr>
                                    </thead>
                                    <tbody>
                                        {% for key in dict_sub %}
                                        <tr>
                                        <td>{{ key }}</td>
                                        {%for col in dict_sub[key]%}
                                        <td>{{ col[1]}}</td>
                                        {%endfor%}
                                        </tr>
                                        {% endfor %}
                                    </tbody>
                                </table>
                            </div>
                            <div id='碱基含量分布' class="layui-tab-item ">
                                <div class="layui-row">
                                    <div class="layui-col-xs12">
                                        <form class="layui-form" >
                                            <select id='tab1' lay-filter='tab1' >
                                                {% for key in dict_sub %}
                                                <option value='{{key}}' name='{{key}}' selected>{{key}}</option>
                                                {% endfor %}
                                            </select> 
                                        </form>  
                                    </div>
                                    
                                    {% for key in dict_sub %}
                                    <div class="layui-row layui-col-space20">                                        
                                        <div id='tab1-{{key}}' class='tab1-quater'>
                                            <div class="layui-col-md6" >
                                                <label>{{key}} read1碱基含量分布图：</label>
                                                <img style="width:80%;margin-top: 25px;margin-bottom: 50px;margin-right: 50px" src="../../1.qc/{{key}}/read1.base_content.png"/>
                                            </div>     
                                            <div  class="layui-col-md6" >
                                                <label>{{key}} read2碱基含量分布图：</label>
                                                <img style="width:80%;margin-top: 25px;margin-bottom: 50px;margin-right: 50px" src="../../1.qc/{{key}}/read2.base_content.png"/>                                                
                                            </div> 
                                            <div>
                                                <p>注：左边代表同一个样本的read1碱基含量和GC分布图,右边代表对应的read2碱基含量和GC分布图。横坐标是Reads碱基坐标，表示Reads上从5’到3’端碱基的依次排列；纵坐标是所有Reads在该测序位置A、C、G、T、N碱基分别占的百分比，不同碱基用不同颜色表示。序列的起始位置与测序的引物接头相连，因此A、C、G、T在起始端会有所波动，后面会趋于稳定（受限制于测序策略，RAD等基于酶切手段测序该图波动较大）。模糊碱基N所占比例越低，说明未知碱基越少，测序样本受系统AT偏好影响越小。</p>
                                            </div>
                                        </div>                                   
                                    </div>                                                   
                                    {% endfor %}
                                </div>
                            </div>                 
                            <div id="碱基质量分布" class="layui-tab-item">
                                <div class="layui-row">
                                    <div class="layui-col-xs12">
                                        <form class="layui-form" >
                                            <select id='tab2' lay-filter='tab2' >
                                                {% for key in dict_sub %}
                                                <option value='{{key}}' name='{{key}}' selected>{{key}}</option>
                                                {% endfor %}
                                            </select> 
                                        </form>  
                                    </div>
                                    
                                    {% for key in dict_sub %}
                                    <div class="layui-row layui-col-space20">                                        
                                        <div id='tab2-{{key}}' class='tab2-quater'>
                                            <div class="layui-col-md6" >
                                                <label>{{key}} read1碱基质量分布图：</label>
                                                <img style="width:80%;margin-top: 25px;margin-bottom: 50px;margin-right: 50px" src="../../1.qc/{{key}}/read1.base_quality.png"/>
                                            </div>     
                                            <div  class="layui-col-md6" >
                                                <label>{{key}} read2碱基质量分布图：</label>
                                                <img style="width:80%;margin-top: 25px;margin-bottom: 50px;margin-right: 50px" src="../../1.qc/{{key}}/read2.base_quality.png"/>                                                
                                            </div> 
                                            <div>
                                                <p>注：左边代表同一个样本的read1碱基质量分布图,右边代表对应的read2碱基质量分布图。横坐标是Reads碱基坐标位置，表示Reads上从5'到3'端依次碱基的排列；纵坐标是所有Reads在该位点处碱基的平均质量值。</p>
                                            </div>
                                        </div>                                   
                                    </div>                                                   
                                    {% endfor %}
                                </div>
                            </div>
                        </div>
                        {% endblock %}
                    </div>
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